Da kann ich dich beruhigen. Vor dem Spannungsabfall kann man sich mit einem Elko und einer Diode prima schützen, vor den Spannungsspitzen auch. Ausgleichsströme kanns eigentlich nicht mehr geben als bei einer gemeinsamen Versorgung auch, denn eine gemeinsame Masse brauchst du eh.
Und wenn das "dicke" Kabel an den Fahrtregler kommt, wo es nx zu suchen hat, dann übt man halt Elektroschweißen. so oder so.